prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

2007

• Elastic properties of ribosomal RNA building blocks: molecular dynamics of the GTPase-associated center rRNA

  RÁZGA Filip KOČA Jaroslav MOKDAD Ali ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2007, ročník: 35, vydání: 12

• Elastic properties of ribosomal RNA building blocks: Molecular dynamics study

  RÁZGA Filip KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Strukturní biofyzika makromolekul II, rok: 2007

• Human telomeric G-DNA - a test example for force field adjustment

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda SVOZIL Daniel ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav

  Článek ve sborníku

  Journal Of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2007

• Molecular dynamics simulations of quadruplex DNA.

  ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  First international meeting on quadruplex DNA,, rok: 2007

• Molecular dynamics simulations of RNA: An in silico single molecule approach

  MCDOWELL Elizabeth ŠPAČKOVÁ Naďa ŠPONER Jiří WALTER Nils

  Článek v odborném periodiku

  BIOPOLYMERS, rok: 2007, ročník: 85, vydání: 2

• Refinement of the AMBER force field for nucleic acids: Improving the description of alfa/gamma conformers

  PEREZ Alberto MARCHAN Ivan SVOZIL Daniel ŠPONER Jiří CHEATHAM Thomas LAUGHTON Charles

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2007, ročník: 92, vydání: 11

• Ribosomal RNA motifs and segments have salient flexibilities

  ŠPONER Jiří MOKDAD Ali RÁZGA Filip RÉBLOVÁ Kamila ŠPAČKOVÁ Naděžda

  Článek ve sborníku

  Journal Of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2007

• Spectroscopic and Theoretical Insights into Sequence Effects of Aminofluorene-Induced Conformational Heterogeneity and Nucleotide Excision Repair

  MENENI Srinivasa SHELL Steven GAO Lan JURECKA Petr LEE Wang SPONER Jiri ZOU Yue CHIARELLI Paul CHO Bongsup

  Článek v odborném periodiku

  Biochemistry, rok: 2007, ročník: 46/2007, vydání: 40

• Study of structure, dynamics and local elasticity of 16S rRNA Helix 44 using molecular dynamics methods.

  RÉBLOVÁ Kamila LANKAS Filip SPONER Jiri

  Článek ve sborníku

  Journal Of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2007

• Theoretical study on structure, stability, and electronic properties of the guanine-Zn-cytosine base pair in M-DNA

  FUENTES-CABRERA Miguel SUMPTER Bobby SPONER Judit SPONER Jiri PETIT Leon WELLS Jack

  Článek v odborném periodiku

  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, rok: 2007, ročník: 111, vydání: 4